More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1670 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  100 
 
 
466 aa  903    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  48.16 
 
 
483 aa  356  5.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2100  MATE efflux family protein  45.7 
 
 
491 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.114433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.99 
 
 
486 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  32.44 
 
 
485 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  33.7 
 
 
500 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  31.71 
 
 
500 aa  194  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  31.03 
 
 
498 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  32.26 
 
 
500 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  31.38 
 
 
518 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  30.34 
 
 
499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  33.12 
 
 
538 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
468 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  32.62 
 
 
470 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  30.11 
 
 
461 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  31.68 
 
 
485 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  32.71 
 
 
481 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  30.9 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.8 
 
 
461 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.69 
 
 
490 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.72 
 
 
525 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.02 
 
 
460 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
454 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  29.55 
 
 
554 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.94 
 
 
461 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
445 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
467 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.35 
 
 
462 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.94 
 
 
454 aa  143  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
458 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
462 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.93 
 
 
458 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.17 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.33 
 
 
469 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
468 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.9 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.33 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.33 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.33 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.11 
 
 
469 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
448 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.11 
 
 
469 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
469 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.38 
 
 
467 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.67 
 
 
469 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
464 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.08 
 
 
454 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
464 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.21 
 
 
446 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
452 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.19 
 
 
505 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.32 
 
 
451 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
450 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.1 
 
 
453 aa  123  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.43 
 
 
475 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  24.35 
 
 
455 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.25 
 
 
457 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
453 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.72 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.83 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  24.14 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  24.14 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  24.14 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.6 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  22.65 
 
 
451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.23 
 
 
496 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.42 
 
 
469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.42 
 
 
469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.64 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.69 
 
 
475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  26.73 
 
 
492 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.58 
 
 
468 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  25 
 
 
455 aa  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
448 aa  113  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.85 
 
 
463 aa  113  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  25.54 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.82 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.37 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  24.6 
 
 
453 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  25.71 
 
 
455 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
447 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  23.31 
 
 
456 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>