More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1929 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  44.79 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  43.23 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 383 aa  99  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 199 aa  95.1  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 287 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 193 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  34.52 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  38.67 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  35.57 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  35.47 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  34.81 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.73 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  30.54 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  30.81 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  30.54 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  37.16 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.05 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 249 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>