More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0414 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  990    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  50.19 
 
 		 1238 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 1526 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  36.17 
 
 		 782 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 1596 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  33.48 
 
 		 1914 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 1714 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  33.18 
 
 		 941 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1101 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1313 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 1285 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  32.09 
 
 		 985 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1063 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1060 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 		 852 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 454 aa  99.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  34.58 
 
 		 1266 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.54 
 
 		 957 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 		 991 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.96 
 
 		 999 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1261 aa  90.9  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  31.76 
 
 		 689 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  26.37 
 
 		 975 aa  90.5  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.9 
 
 		 609 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 		 1295 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.5 
 
 		 809 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 816 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 1215 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.71 
 
 		 725 aa  87  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.51 
 
 		 568 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 568 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.8 
 
 		 1180 aa  86.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1298 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 799 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1450 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  31.91 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.95 
 
 		 1328 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 1279 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1444  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 771 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 911 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.15 
 
 		 2145 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 843 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 1162 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.49 
 
 		 885 aa  80.5  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 		 1424 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 1162 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.11 
 
 		 828 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 767 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.16 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1298 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 		 1186 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  33.03 
 
 		 919 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1550 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2620  Tetratricopeptide TPR_4  26.83 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.866097  normal  0.0216756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1025 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.3 
 
 		 732 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  28.19 
 
 		 755 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1105 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 785 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1113  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0928766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.78 
 
 		 945 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  24.16 
 
 		 1147 aa  73.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.75 
 
 		 1429 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  27.15 
 
 		 971 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  24.5 
 
 		 1022 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 636 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 343 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 659 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.78 
 
 		 1009 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 802 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  27.15 
 
 		 991 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 760 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  27.8 
 
 		 834 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  30.95 
 
 		 695 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 872 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 910 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 751 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 924 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  27.55 
 
 		 1013 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 714 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 923 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.63 
 
 		 1195 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  25.72 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1404 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  27.8 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  24.69 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  29.17 
 
 		 992 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  27.57 
 
 		 1021 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 953 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>