More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0856 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 563 aa  1145    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.08 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 		 565 aa  342  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 566 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 562 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.27 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  27.16 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 567 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.94 
 
 		 573 aa  183  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 573 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 568 aa  173  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.36 
 
 		 572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  26.68 
 
 		 632 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.36 
 
 		 566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 638 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 594 aa  124  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  40.13 
 
 		 581 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  30.49 
 
 		 583 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.65 
 
 		 603 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 		 553 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 621 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 722 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  30.56 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 572 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  28.75 
 
 		 573 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  30.38 
 
 		 593 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  30.45 
 
 		 572 aa  110  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 566 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 595 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  32.39 
 
 		 619 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 617 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 594 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  31.36 
 
 		 592 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.29 
 
 		 425 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  41.01 
 
 		 621 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  41.01 
 
 		 621 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 592 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 566 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  29.68 
 
 		 677 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1676 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 574 aa  101  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  27.04 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 579 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 575 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  35.76 
 
 		 584 aa  99.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  32.18 
 
 		 625 aa  99  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 571 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 586 aa  98.6  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 572 aa  98.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  26.6 
 
 		 590 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 548 aa  96.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  32.94 
 
 		 616 aa  94.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 		 592 aa  94.4  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  26.6 
 
 		 635 aa  93.6  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 616 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 576 aa  93.2  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  35.98 
 
 		 609 aa  93.2  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  26.64 
 
 		 579 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 610 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 599 aa  92.8  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  25.64 
 
 		 575 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 573 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 804 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 		 610 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  28.69 
 
 		 562 aa  91.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 585 aa  91.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 2262 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 585 aa  90.9  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 927 aa  90.1  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 573 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 556 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 599 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 573 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 584 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 607 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 574 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.72 
 
 		 564 aa  88.6  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  31.18 
 
 		 575 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.94 
 
 		 574 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.32 
 
 		 633 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  31.61 
 
 		 573 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 619 aa  87  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  32.93 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  25.34 
 
 		 595 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 573 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  32.7 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  31.05 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 631 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>