260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1413 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 323 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  33.09 
 
 		 446 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  31.68 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0560  Peptidoglycan-binding LysM  28.86 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0820449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  36.5 
 
 		 444 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  40.38 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0475  hypothetical protein  34.96 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  30.81 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  34.12 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2437  hypothetical protein  38.46 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.693761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  31.02 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  32.34 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  30.96 
 
 		 733 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  27.17 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  31.17 
 
 		 257 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  31.62 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  28.07 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  33.13 
 
 		 546 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  28.07 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  31.85 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  26.9 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.8 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  37.41 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  27.78 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  31.14 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  29.41 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  33.96 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  29.41 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  25.69 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  36.69 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  35.97 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  28.95 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.71 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  34.93 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.71 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  27.01 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.69 
 
 		 797 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  25.15 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  27.01 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.49 
 
 		 530 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  34.72 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  26.32 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  27.49 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  30.14 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  29.86 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  26.9 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  26.9 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.17 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.79 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  26.9 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  29.86 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  26.9 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.94 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.77 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  29.5 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  30.07 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  34.03 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  30.07 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  34.03 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  29.41 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  29.29 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  28.75 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  29.29 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  28.57 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  29.29 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  29.29 
 
 		 519 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  30.92 
 
 		 563 aa  55.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  28.99 
 
 		 503 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  30.94 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  27.19 
 
 		 473 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  29.41 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  27.86 
 
 		 602 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  29.94 
 
 		 427 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.74 
 
 		 617 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  26.83 
 
 		 544 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.37 
 
 		 554 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  37.5 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  29.94 
 
 		 427 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  31.33 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  52.08 
 
 		 438 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  33.81 
 
 		 471 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  29.58 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 		 164 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  27.85 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  44.62 
 
 		 242 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  29.71 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  25.87 
 
 		 515 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.5 
 
 		 543 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  26.92 
 
 		 289 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  26.09 
 
 		 557 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  31.72 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  26.09 
 
 		 542 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  28.47 
 
 		 476 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  31.47 
 
 		 440 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  28.74 
 
 		 265 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  28.47 
 
 		 476 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  27.75 
 
 		 467 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>