169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3141 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 
831 aa  1713    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  67.43 
 
 
396 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  57.75 
 
 
820 aa  237  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  50.45 
 
 
554 aa  207  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  46.72 
 
 
340 aa  195  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  42.53 
 
 
1880 aa  195  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  46.19 
 
 
285 aa  187  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  40.57 
 
 
419 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  38.14 
 
 
258 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  37.89 
 
 
230 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  37.95 
 
 
251 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  35.29 
 
 
727 aa  144  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  34.08 
 
 
266 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
266 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  36.11 
 
 
627 aa  138  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  34.85 
 
 
922 aa  137  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  34.35 
 
 
252 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  38.34 
 
 
218 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  38.99 
 
 
239 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  48.2 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  41.18 
 
 
165 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.76 
 
 
809 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  43.26 
 
 
847 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  35.4 
 
 
571 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  55.81 
 
 
707 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  30.93 
 
 
552 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  29.59 
 
 
551 aa  107  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  28.98 
 
 
491 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  32.85 
 
 
233 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  33.33 
 
 
280 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  37.59 
 
 
649 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  27.88 
 
 
552 aa  102  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  32.08 
 
 
230 aa  101  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  29.63 
 
 
546 aa  101  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  27.88 
 
 
552 aa  101  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  28.29 
 
 
865 aa  101  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.55 
 
 
790 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  39.84 
 
 
540 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  34.52 
 
 
277 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
238 aa  88.6  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  47.25 
 
 
736 aa  87.8  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  43.93 
 
 
591 aa  87.8  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 
660 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  43.88 
 
 
600 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  34.52 
 
 
769 aa  84.7  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  40.54 
 
 
700 aa  84.7  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.56 
 
 
582 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  42.98 
 
 
511 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  52.05 
 
 
415 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  47.3 
 
 
814 aa  82  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  55.56 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  38.58 
 
 
1016 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  43.75 
 
 
423 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  35.48 
 
 
401 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  50.7 
 
 
630 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
484 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  52.17 
 
 
567 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  48.57 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  47.62 
 
 
526 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  48.65 
 
 
425 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 
710 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.68 
 
 
842 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  38.74 
 
 
914 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 
1051 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  49.35 
 
 
245 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.26 
 
 
469 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  51.56 
 
 
571 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  43.66 
 
 
532 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  36.04 
 
 
747 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 
563 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  46.32 
 
 
739 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  47.14 
 
 
730 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  39.25 
 
 
1077 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  45.88 
 
 
599 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  50.6 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  49.3 
 
 
563 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  36.94 
 
 
789 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  41.07 
 
 
1316 aa  72  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  25.57 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  48.15 
 
 
558 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 
649 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.45 
 
 
710 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 
619 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  45.07 
 
 
928 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  47.44 
 
 
773 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.57 
 
 
324 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  47.14 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  45.83 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.3 
 
 
537 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.2 
 
 
2073 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  44.93 
 
 
535 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  32.8 
 
 
898 aa  67.8  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  39.23 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
789 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  47.14 
 
 
639 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  40.48 
 
 
900 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.3 
 
 
707 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 
837 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 
895 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.43 
 
 
350 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>