More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1067 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  100 
 
 		 453 aa  904    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  36.19 
 
 		 468 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 477 aa  199  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.46 
 
 		 454 aa  176  6e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 518 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 460 aa  152  8e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 538 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 500 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 554 aa  150  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 458 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 505 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 500 aa  143  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 446 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25 
 
 		 475 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 453 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.14 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.52 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.52 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  23.52 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1086  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 616 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000719334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 475 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.3 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.08 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.56 
 
 		 463 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 470 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.3 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  22.86 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 443 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.83 
 
 		 456 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  25 
 
 		 446 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 470 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  25.53 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 469 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  21.6 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  21.9 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.22 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 442 aa  113  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.67 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  27.03 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  23.74 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>