More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0617 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 579 aa  1170    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  45.41 
 
 		 591 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.55 
 
 		 577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  40.36 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.69 
 
 		 571 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.55 
 
 		 582 aa  345  8.999999999999999e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 562 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 602 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  24.3 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.63 
 
 		 573 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 573 aa  99.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.91 
 
 		 804 aa  94  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.8 
 
 		 573 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 594 aa  91.3  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31.56 
 
 		 572 aa  91.7  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0021  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 		 593 aa  90.5  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.73 
 
 		 612 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 722 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.89 
 
 		 935 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 567 aa  87.4  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 594 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.39 
 
 		 563 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.1 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 		 572 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 934 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 		 2240 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.65 
 
 		 729 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  32.43 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  31.41 
 
 		 592 aa  77  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 548 aa  76.6  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  37.29 
 
 		 632 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  24.15 
 
 		 918 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  25.48 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 566 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 900 aa  73.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.71 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  28.9 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  28.87 
 
 		 593 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 		 594 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 617 aa  71.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  34.71 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  31.4 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  26.98 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.26 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  26.97 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  26.3 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 622 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.63 
 
 		 599 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 559 aa  68.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 638 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  35.71 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 585 aa  68.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 610 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 599 aa  67.4  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  31.71 
 
 		 619 aa  67  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 		 564 aa  67  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  37.61 
 
 		 591 aa  67  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 613 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  29.47 
 
 		 621 aa  66.6  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 952 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 579 aa  66.6  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  29.32 
 
 		 621 aa  66.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.07 
 
 		 571 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  43.16 
 
 		 931 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 884 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1121 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 		 880 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 860 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 621 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  30.67 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 767 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 617 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  22.33 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.54 
 
 		 619 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.15 
 
 		 882 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.55 
 
 		 882 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  28.63 
 
 		 562 aa  63.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>