More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4666 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  36.76 
 
 		 264 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 266 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 242 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 243 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  30 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  30.11 
 
 		 246 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  35.22 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  31.94 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  30.12 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  29.07 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  45.07 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
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NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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