103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1336 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  72.77 
 
 		 2042 aa  1287    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  100 
 
 		 978 aa  1992    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.9 
 
 		 985 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 730 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  29.69 
 
 		 1369 aa  163  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.12 
 
 		 887 aa  162  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 		 742 aa  159  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  29.8 
 
 		 526 aa  158  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 		 739 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 736 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 		 563 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  30.02 
 
 		 725 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  30.77 
 
 		 847 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 707 aa  154  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  31.21 
 
 		 686 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  29.94 
 
 		 880 aa  154  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  29.48 
 
 		 990 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  29.61 
 
 		 1759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  28.93 
 
 		 715 aa  147  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 846 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  28.98 
 
 		 794 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1067 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  27.67 
 
 		 737 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 611 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  27.79 
 
 		 710 aa  125  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  25.92 
 
 		 1017 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  26.97 
 
 		 984 aa  118  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 1137 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 789 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  29.18 
 
 		 778 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  28.1 
 
 		 757 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 961 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  25.67 
 
 		 949 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 894 aa  101  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 928 aa  101  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  26.81 
 
 		 854 aa  98.2  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  25.39 
 
 		 646 aa  87.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.39 
 
 		 998 aa  87  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  25.68 
 
 		 833 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 1224 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  26.53 
 
 		 864 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  23.71 
 
 		 885 aa  84.7  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.6 
 
 		 762 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  25.64 
 
 		 874 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  26.8 
 
 		 851 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  23.21 
 
 		 591 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.32 
 
 		 927 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  24.2 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  24.18 
 
 		 906 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  25.28 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 895 aa  75.5  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  30.58 
 
 		 846 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.62 
 
 		 621 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  23.68 
 
 		 1100 aa  73.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 812 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  24.3 
 
 		 854 aa  68.9  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  31.05 
 
 		 1345 aa  68.6  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  21.88 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  34.88 
 
 		 888 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.13 
 
 		 786 aa  65.1  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  26.06 
 
 		 815 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  23.53 
 
 		 1076 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.96 
 
 		 1288 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  23.45 
 
 		 1601 aa  61.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.73 
 
 		 2713 aa  60.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.16 
 
 		 3793 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  33.01 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  24.42 
 
 		 1105 aa  60.1  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  26.49 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  25.41 
 
 		 1266 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  23.04 
 
 		 875 aa  57.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  33.56 
 
 		 815 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  31.87 
 
 		 885 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  28.95 
 
 		 496 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  24.5 
 
 		 1295 aa  55.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  24.39 
 
 		 1108 aa  54.7  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  28.76 
 
 		 2270 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.12 
 
 		 1657 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.32 
 
 		 611 aa  53.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.16 
 
 		 900 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.39 
 
 		 582 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  33.04 
 
 		 2833 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1978  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase  34.33 
 
 		 797 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  30.28 
 
 		 665 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.33 
 
 		 867 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  23.3 
 
 		 587 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  30.2 
 
 		 2402 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  30.99 
 
 		 490 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  31.29 
 
 		 1414 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 632 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  32.94 
 
 		 739 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1969 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  26.9 
 
 		 938 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  29.51 
 
 		 4071 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  30 
 
 		 1059 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  48.33 
 
 		 4429 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  26.7 
 
 		 794 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1976 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  30.95 
 
 		 356 aa  44.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>