More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2650 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  91.28 
 
 		 204 aa  358  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  90.77 
 
 		 204 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  77.44 
 
 		 217 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 217 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 217 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 217 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 208 aa  271  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 212 aa  271  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 208 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 203 aa  257  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  58.25 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  55.67 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 207 aa  205  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 203 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  35.79 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  32.47 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 207 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 207 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  33.17 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.13 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  40.17 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  37.01 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.92 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.18 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.71 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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