More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0016 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  32.71 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 722 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.15 
 
 		 571 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.11 
 
 		 582 aa  86.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 557 aa  85.1  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.4 
 
 		 573 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.2 
 
 		 573 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 573 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 568 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 566 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30.98 
 
 		 677 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 567 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 572 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  29.44 
 
 		 642 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 		 804 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 632 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.45 
 
 		 579 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  29.49 
 
 		 645 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.38 
 
 		 645 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 592 aa  68.2  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 638 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 594 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 579 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 587 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.07 
 
 		 594 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.96 
 
 		 633 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.23 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.56 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  35.71 
 
 		 575 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  35.87 
 
 		 583 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 631 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 593 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  32.28 
 
 		 592 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  33.98 
 
 		 619 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.04 
 
 		 633 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 729 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 610 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.25 
 
 		 553 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  27.68 
 
 		 575 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 571 aa  62.4  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  22.54 
 
 		 621 aa  62.4  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  37.35 
 
 		 591 aa  62  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  30.25 
 
 		 603 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  34.69 
 
 		 574 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 556 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  22.54 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 860 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1096 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 3145 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1676 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  38.64 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 575 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  34.69 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 767 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 883 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  29.92 
 
 		 593 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  26.83 
 
 		 590 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 573 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 617 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 593 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 607 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 607 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 607 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 804 aa  58.5  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  27.52 
 
 		 572 aa  58.5  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 621 aa  58.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  34.44 
 
 		 573 aa  58.5  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 642 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.96 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 582 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.6 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.33 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 1737 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 617 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>