More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2120 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  83.33 
 
 		 199 aa  313  9e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  70.47 
 
 		 190 aa  258  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  69.95 
 
 		 190 aa  256  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  64.77 
 
 		 189 aa  248  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  62.69 
 
 		 190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 187 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  62.18 
 
 		 186 aa  225  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 192 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  65.1 
 
 		 198 aa  221  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  58.03 
 
 		 187 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  43.16 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  30.12 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  26.4 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  21.46 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  26.17 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 125 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  19.65 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  39.06 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 420 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 260 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  20.23 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 357 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 307 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>