More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1032 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1032  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  100 
 
 		 314 aa  617  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.0222288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1123  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  69.84 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.095131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5735  pseudouridine synthase, RluA family  66.12 
 
 		 312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2911  pseudouridine synthase, RluA family  69.48 
 
 		 309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000259384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5746  pseudouridine synthase, RluA family  64.84 
 
 		 310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2401  pseudouridine synthase, RluA family  70.45 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  65.46 
 
 		 310 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27270  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  66.01 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.42777  normal  0.302751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2883  RluA family pseudouridine synthase  67.76 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3427  RluA family pseudouridine synthase  66.78 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3195  pseudouridine synthase, RluA family  67.54 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000221583  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3188  pseudouridine synthase, RluA family  69.44 
 
 		 307 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4000  pseudouridine synthase RluA family  63.84 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22700  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  67.43 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.17143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2995  pseudouridine synthase, RluA family  66.99 
 
 		 308 aa  388  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3201  RluA family pseudouridine synthase  67.66 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.887852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0912  pseudouridine synthase, RluA family  65.69 
 
 		 308 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.13 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5086  RluA family pseudouridine synthase  66.99 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00722052  hitchhiker  0.000548014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3092  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.13 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.598347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3152  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.13 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2774  RluA family pseudouridine synthase  64.8 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538883  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3639  RluA family pseudouridine synthase  64.38 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.323041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1426  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.71 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128873  normal  0.0393122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2627  pseudouridine synthase, RluA family  61.56 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981062  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1084  pseudouridine synthase, RluA family  62.66 
 
 		 313 aa  374  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1294  pseudouridine synthase, RluA family  68.85 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3248  pseudouridine synthase, RluA family  68.65 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16460  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  62.21 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.0163428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1605  pseudouridine synthase, RluA family  68.85 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3052  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  64.17 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11573  pseudouridylate synthase  62.83 
 
 		 308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10900  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  62.38 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  60.67 
 
 		 308 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0928054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1581  pseudouridine synthase, RluA family  60.74 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13500  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  57.79 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  45.1 
 
 		 321 aa  271  8.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.54 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  40.54 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0141  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  57.21 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.93 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  44.63 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  46.67 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  43.23 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  41.51 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  42.9 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  45.49 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  44.41 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  41.69 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.89 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  39.53 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  43.33 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5641  RluA family pseudouridine synthase  43.2 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0784245  normal  0.0662389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  39.36 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  39.01 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2003  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.03 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.704766  normal  0.26865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.23 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0473  pseudouridine synthase, RluA family  44.24 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.45 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  37.97 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  36.75 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  36.42 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  41.8 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0345  RluA family pseudouridine synthase  42.72 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  37.54 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3046  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.81 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  33.9 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  33.9 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.04 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.73 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  33.56 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.98 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  42.23 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.75 
 
 		 334 aa  188  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  40.06 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.62 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  42.39 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  42.48 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1335  RluA family pseudouridine synthase  38.26 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000257398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  39.94 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.43 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  36.58 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2822  RluA family pseudouridine synthase  37.34 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000591979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0606  pseudouridine synthase RluD  39.68 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.32929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1520  pseudouridine synthase, RluA family  37.37 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  37.33 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.19 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.14 
 
 		 391 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.08 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1901  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.91 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  39.93 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.08 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  41.1 
 
 		 370 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3499  lysozyme  38.36 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  normal  0.0395097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  39.35 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  35.33 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  36.79 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.1 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  42.72 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.48756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>