More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_13500 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_13500  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  100 
 
 
320 aa  633  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  65.5 
 
 
308 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0928054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1581  pseudouridine synthase, RluA family  67.31 
 
 
308 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2627  pseudouridine synthase, RluA family  60.4 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5746  pseudouridine synthase, RluA family  58.25 
 
 
310 aa  352  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22700  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  61.66 
 
 
311 aa  351  8.999999999999999e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.17143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5735  pseudouridine synthase, RluA family  59.08 
 
 
312 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3195  pseudouridine synthase, RluA family  59.42 
 
 
308 aa  348  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000221583  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3052  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  60.91 
 
 
312 aa  345  8.999999999999999e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27270  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  58.01 
 
 
308 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.42777  normal  0.302751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16460  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  57.51 
 
 
309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.0163428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2774  RluA family pseudouridine synthase  59.55 
 
 
309 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538883  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3188  pseudouridine synthase, RluA family  62.42 
 
 
307 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3639  RluA family pseudouridine synthase  59.55 
 
 
309 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.323041  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2401  pseudouridine synthase, RluA family  61.24 
 
 
309 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11573  pseudouridylate synthase  58.9 
 
 
308 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4000  pseudouridine synthase RluA family  58 
 
 
312 aa  339  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  58.63 
 
 
304 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3092  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  58.63 
 
 
304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.598347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3152  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  58.63 
 
 
304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1294  pseudouridine synthase, RluA family  61.56 
 
 
310 aa  335  5e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2995  pseudouridine synthase, RluA family  56.31 
 
 
308 aa  335  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10900  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  57 
 
 
308 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1084  pseudouridine synthase, RluA family  56.49 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1032  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  57 
 
 
314 aa  325  9e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.0222288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1605  pseudouridine synthase, RluA family  60.13 
 
 
311 aa  322  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3427  RluA family pseudouridine synthase  57.51 
 
 
314 aa  322  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3201  RluA family pseudouridine synthase  57.23 
 
 
314 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.887852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2883  RluA family pseudouridine synthase  57.28 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5086  RluA family pseudouridine synthase  60.59 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00722052  hitchhiker  0.000548014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1426  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  58.36 
 
 
313 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128873  normal  0.0393122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  53.97 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2911  pseudouridine synthase, RluA family  56.54 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000259384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3248  pseudouridine synthase, RluA family  58.2 
 
 
315 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1123  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  56.48 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.095131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0912  pseudouridine synthase, RluA family  54.22 
 
 
308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  45.81 
 
 
321 aa  276  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  44.13 
 
 
331 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.46 
 
 
300 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.94 
 
 
300 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  43.65 
 
 
316 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  42.21 
 
 
315 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  36.81 
 
 
305 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  36.36 
 
 
306 aa  202  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  42.95 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  41.88 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  42.58 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  38.46 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  38.14 
 
 
306 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0141  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  53.57 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  38.91 
 
 
305 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  40.13 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  37.7 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  38.22 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2164  RluA family pseudouridine synthase  39.02 
 
 
482 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.317837  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  38.89 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  37.38 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  42.23 
 
 
325 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  39.81 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.06 
 
 
333 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  45.08 
 
 
313 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.03 
 
 
312 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  42.36 
 
 
327 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  34.88 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1335  RluA family pseudouridine synthase  39.03 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000257398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  42.28 
 
 
331 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  40.5 
 
 
315 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.39 
 
 
305 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  41.53 
 
 
326 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  37.42 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.3 
 
 
303 aa  189  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  41.98 
 
 
327 aa  189  8e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0771  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.18 
 
 
323 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.497941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  40.26 
 
 
352 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.45 
 
 
296 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.84 
 
 
347 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  39.47 
 
 
334 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.84 
 
 
334 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.38 
 
 
313 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1194  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.18 
 
 
323 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.79 
 
 
296 aa  186  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  40.26 
 
 
352 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0606  pseudouridine synthase RluD  40.72 
 
 
391 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.32929  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  33.44 
 
 
303 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40 
 
 
324 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  29.48 
 
 
322 aa  185  8e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  39.68 
 
 
309 aa  185  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  37.3 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.29 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  38.53 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  38.4 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0884  23S rRNA pseudouridine synthase D  39.5 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0692792  normal  0.0818759 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  38.83 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  38.65 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  36.96 
 
 
305 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.33 
 
 
306 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  36.96 
 
 
305 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.36 
 
 
308 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  39.02 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  38.54 
 
 
304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>