More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0771 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1194  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  99.38 
 
 
323 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0771  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  100 
 
 
323 aa  655    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.497941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2550  pseudouridine synthase, RluD  55.95 
 
 
319 aa  360  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.347335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1335  RluA family pseudouridine synthase  50.79 
 
 
327 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000257398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  54.66 
 
 
313 aa  338  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  53.57 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2950  RluA family pseudouridine synthase  53.05 
 
 
323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118178  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  52.4 
 
 
329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  50.65 
 
 
325 aa  332  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0884  23S rRNA pseudouridine synthase D  49.22 
 
 
325 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0692792  normal  0.0818759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2605  pseudouridylate synthase  54.98 
 
 
324 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000283334  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3477  23S rRNA pseudouridine synthase D  49.22 
 
 
325 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118484  normal  0.239433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3351  23S rRNA pseudouridine synthase D  49.22 
 
 
325 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3499  lysozyme  52.09 
 
 
323 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  normal  0.0395097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3722  RluA family pseudouridine synthase  50.96 
 
 
323 aa  328  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.302376  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2975  23S rRNA pseudouridine synthase D  49.06 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0427325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2850  pseudouridine synthase, RluA family  50 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3835  23S rRNA pseudouridine synthase D  49.06 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000664381  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02484  23S rRNA pseudouridine synthase  48.74 
 
 
326 aa  326  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1078  pseudouridine synthase, RluA family  48.74 
 
 
326 aa  326  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0158788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2880  23S rRNA pseudouridine synthase D  49.06 
 
 
326 aa  326  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0196126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3915  23S rRNA pseudouridine synthase D  51.45 
 
 
324 aa  326  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.16 
 
 
333 aa  326  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2752  23S rRNA pseudouridine synthase D  48.74 
 
 
326 aa  326  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000325368  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1087  23S rRNA pseudouridine synthase D  48.74 
 
 
326 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.097503  decreased coverage  0.000000284548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02448  hypothetical protein  48.74 
 
 
326 aa  326  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.166137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01005  23S rRNA pseudouridine synthase D  47.5 
 
 
325 aa  326  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0664  23S rRNA pseudouridine synthase D  49.52 
 
 
324 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0008107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2748  23S rRNA pseudouridine synthase D  48.74 
 
 
326 aa  325  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0255935  normal  0.237135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2863  pseudouridine synthase, RluD  50 
 
 
324 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1002  pseudouridine synthase, RluA family  48.57 
 
 
325 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4836  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.32 
 
 
320 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.32 
 
 
320 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0726  pseudouridine synthase, RluD  50.64 
 
 
320 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  53.77 
 
 
313 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004394  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.48 
 
 
325 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.530574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.41 
 
 
323 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000045802  normal  0.354843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3074  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.41 
 
 
323 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000195279  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0667  pseudouridine synthase, RluA family protein  51.45 
 
 
324 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0233551  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3171  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.41 
 
 
323 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000261033  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  50.48 
 
 
352 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5183  pseudouridine synthase  51.8 
 
 
320 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  50.16 
 
 
352 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11940  Pseudouridine synthase  51.13 
 
 
336 aa  320  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3074  23S rRNA pseudouridine synthase D  48.11 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.0295932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  51.48 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.16 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3214  23S rRNA pseudouridine synthase D  48.91 
 
 
327 aa  318  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000301584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1022  RluA family pseudouridine synthase  51.77 
 
 
324 aa  318  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000246501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2034  pseudouridine synthase, RluA family  50.16 
 
 
340 aa  317  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0680786  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0367  23S rRNA pseudouridine synthase D  48.86 
 
 
321 aa  317  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  49.52 
 
 
352 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2991  23S rRNA pseudouridine synthase D  47.95 
 
 
326 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3143  23S rRNA pseudouridine synthase D  47.65 
 
 
325 aa  315  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2774  23S rRNA pseudouridine synthase D  47.95 
 
 
326 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00023272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01440  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.83 
 
 
327 aa  316  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1086  RluA family pseudouridine synthase  51.13 
 
 
324 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000750012  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1017  RluA family pseudouridine synthase  51.13 
 
 
324 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1119  RluA family pseudouridine synthase  51.13 
 
 
324 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000317979  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2858  23S rRNA pseudouridine synthase D  47.95 
 
 
326 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2877  23S rRNA pseudouridine synthase D  47.95 
 
 
326 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2879  23S rRNA pseudouridine synthase D  47.95 
 
 
326 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.206538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3272  pseudouridine synthase, RluA family  51.13 
 
 
324 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000267118  normal  0.0414307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1136  23S rRNA pseudouridine synthase D  48.57 
 
 
325 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.339776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3265  pseudouridine synthase, RluA family protein  49.37 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0238  23S rRNA pseudouridine synthase D  45.65 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.846353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.28 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  48.71 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3166  RluA family pseudouridine synthase  49.68 
 
 
323 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  48.39 
 
 
327 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1370  pseudouridine synthase, RluD  47.04 
 
 
352 aa  309  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  51.61 
 
 
334 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3611  RluA family pseudouridine synthase  46.84 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354938  hitchhiker  0.00827113 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  51.15 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  52.48 
 
 
327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1612  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.67 
 
 
356 aa  294  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2551  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.4 
 
 
321 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.682293  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1287  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (pseudouridylate synthase) (Uracil hydrolyase)  46.91 
 
 
321 aa  289  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0193  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.89 
 
 
319 aa  288  6e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.341047  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1286  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (pseudouridylate synthase) (Uracil hydrolyase)  46.25 
 
 
321 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.62 
 
 
318 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.62 
 
 
318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  48.87 
 
 
391 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  45.78 
 
 
318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  48.39 
 
 
400 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  50 
 
 
436 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  48.39 
 
 
405 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  48.39 
 
 
407 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.63 
 
 
319 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  48.71 
 
 
402 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  44.41 
 
 
310 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  48.71 
 
 
360 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  48.71 
 
 
402 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  48.71 
 
 
402 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  47.91 
 
 
431 aa  262  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.41 
 
 
438 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  47.77 
 
 
358 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  47.77 
 
 
370 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  45.86 
 
 
403 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1127  pseudouridine synthase, RluD  42.01 
 
 
396 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.965473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>