More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0869 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  100 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  61.77 
 
 
334 aa  364  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  58.28 
 
 
306 aa  351  8e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  54.13 
 
 
303 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  56.4 
 
 
305 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  55.78 
 
 
305 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  59.26 
 
 
331 aa  335  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  53 
 
 
304 aa  335  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  56.9 
 
 
304 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  54.75 
 
 
304 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  55.45 
 
 
296 aa  325  5e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  57.58 
 
 
309 aa  325  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.68 
 
 
301 aa  324  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  52.29 
 
 
313 aa  323  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  51.16 
 
 
302 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  53.08 
 
 
302 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  50.83 
 
 
302 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.83 
 
 
302 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  50.83 
 
 
302 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.83 
 
 
302 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  50.5 
 
 
302 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  50.83 
 
 
302 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  50.5 
 
 
302 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  50.17 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  51.37 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  52.82 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  54.7 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  54.36 
 
 
306 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.82 
 
 
296 aa  308  9e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  53.64 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.16 
 
 
305 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  50 
 
 
305 aa  298  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  50 
 
 
305 aa  298  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  50.8 
 
 
320 aa  298  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  51.46 
 
 
313 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  50 
 
 
326 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  48.65 
 
 
303 aa  295  8e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  51.44 
 
 
322 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.5 
 
 
312 aa  289  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  49.36 
 
 
315 aa  289  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  53.33 
 
 
310 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.2 
 
 
319 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  50.16 
 
 
326 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.09 
 
 
334 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.09 
 
 
347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.78 
 
 
308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  48.28 
 
 
300 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  47.85 
 
 
306 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  50.5 
 
 
319 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.34 
 
 
304 aa  279  5e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  48.33 
 
 
334 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  49.83 
 
 
319 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  48.46 
 
 
329 aa  275  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  47.65 
 
 
304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.5 
 
 
343 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  50.51 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1373  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.94 
 
 
312 aa  269  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  51.19 
 
 
323 aa  268  7e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02221  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  46.58 
 
 
320 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.135305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  45.54 
 
 
306 aa  267  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  48.37 
 
 
318 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  48.03 
 
 
316 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0749  pseudouridine synthase, RluA family  48.69 
 
 
318 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  47.85 
 
 
315 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1072  RluA family pseudouridine synthase  48.78 
 
 
349 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0863187  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  46.84 
 
 
311 aa  263  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  47.18 
 
 
311 aa  263  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2409  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  48.48 
 
 
349 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2215  RluA family pseudouridine synthase  48.82 
 
 
341 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  45.52 
 
 
311 aa  261  6.999999999999999e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2141  pseudouridine synthase, RluD  48.99 
 
 
339 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  48.62 
 
 
343 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  47.7 
 
 
314 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  46.05 
 
 
319 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02131  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  46.05 
 
 
319 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0345  RluA family pseudouridine synthase  49.83 
 
 
351 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  46.2 
 
 
336 aa  256  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  48.33 
 
 
313 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997976  normal  0.952064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  41.41 
 
 
305 aa  255  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2457  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  48.12 
 
 
333 aa  254  9e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0195  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  45.7 
 
 
319 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0799995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  46.65 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  44.63 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  49.35 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.28 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.1 
 
 
332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  46.5 
 
 
341 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  46.38 
 
 
377 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.95 
 
 
321 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  46.23 
 
 
326 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1573  RluA family pseudouridine synthase  48.29 
 
 
349 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105453  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  50.49 
 
 
327 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  46.62 
 
 
376 aa  252  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2467  pseudouridine synthase, RluA family  48.65 
 
 
322 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.235173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2610  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50.16 
 
 
347 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000916578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2118  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.92 
 
 
337 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0606  pseudouridine synthase RluD  46.89 
 
 
391 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.32929  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  45.89 
 
 
326 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2719  RluA family pseudouridine synthase  48.36 
 
 
332 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.344852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3401  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.48 
 
 
310 aa  248  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>