More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2911 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2911  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 		 309 aa  614  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000259384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2883  RluA family pseudouridine synthase  78.96 
 
 		 309 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  77.99 
 
 		 310 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1123  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  78.96 
 
 		 309 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.095131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0912  pseudouridine synthase, RluA family  75 
 
 		 308 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27270  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  69.51 
 
 		 308 aa  424  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.42777  normal  0.302751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5746  pseudouridine synthase, RluA family  68.08 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5735  pseudouridine synthase, RluA family  66.67 
 
 		 312 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3188  pseudouridine synthase, RluA family  71.24 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3195  pseudouridine synthase, RluA family  68.52 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000221583  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2627  pseudouridine synthase, RluA family  65.03 
 
 		 308 aa  407  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22700  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  66.99 
 
 		 311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.17143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2401  pseudouridine synthase, RluA family  70.26 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3248  pseudouridine synthase, RluA family  70.16 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1032  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  69.48 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.0222288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3427  RluA family pseudouridine synthase  67.66 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5086  RluA family pseudouridine synthase  66.12 
 
 		 313 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00722052  hitchhiker  0.000548014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1426  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  66.67 
 
 		 313 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128873  normal  0.0393122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3052  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  67.54 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4000  pseudouridine synthase RluA family  64.03 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782666 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16460  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  62.01 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.0163428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3639  RluA family pseudouridine synthase  64.47 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.323041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1084  pseudouridine synthase, RluA family  61.76 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1294  pseudouridine synthase, RluA family  68.65 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3201  RluA family pseudouridine synthase  67.33 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.887852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2774  RluA family pseudouridine synthase  64.47 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538883  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2995  pseudouridine synthase, RluA family  63.19 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3092  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  63.04 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.598347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3152  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  63.04 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  63.04 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1605  pseudouridine synthase, RluA family  68.4 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  63.67 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0928054  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11573  pseudouridylate synthase  62.01 
 
 		 308 aa  359  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1581  pseudouridine synthase, RluA family  62.29 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10900  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  57.28 
 
 		 308 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13500  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  56.54 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  43.04 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1335  RluA family pseudouridine synthase  42.63 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000257398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  46.6 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  46.2 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  45.85 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  44.12 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.77 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.74 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  43.37 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  43.08 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  38.91 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0141  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  51.53 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  40.2 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  44.63 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4836  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.23 
 
 		 320 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.2 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  42.81 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  43.14 
 
 		 309 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  40.07 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  42.77 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3499  lysozyme  41.18 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  normal  0.0395097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  42.49 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11940  Pseudouridine synthase  43.73 
 
 		 336 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  39.6 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  40.47 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  40.85 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.26 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  42.09 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  41.61 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  40.42 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1901  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.06 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  42.17 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  40.77 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  42.55 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.36 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.25 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.83 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.54 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01005  23S rRNA pseudouridine synthase D  42.02 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  40.82 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004394  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.5 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.530574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  38.93 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.9 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  41.25 
 
 		 331 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0726  pseudouridine synthase, RluD  41.94 
 
 		 320 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  40.86 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  38.59 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  42.81 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.94 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  36.08 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3722  RluA family pseudouridine synthase  40.91 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.302376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  41.94 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0345  RluA family pseudouridine synthase  42.62 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  39.31 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  38.51 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5183  pseudouridine synthase  42.81 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  39.6 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.87 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.04 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2950  RluA family pseudouridine synthase  42.05 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118178  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  44.59 
 
 		 400 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.74 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>