More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1177 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 402 aa  764    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  52.03 
 
 		 386 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  55.19 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  52.54 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  50.13 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  52.62 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  52.94 
 
 		 395 aa  296  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.31 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  46.58 
 
 		 424 aa  263  6e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  45.57 
 
 		 391 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  46.25 
 
 		 475 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  48.45 
 
 		 374 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  45.77 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  43.54 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  48.4 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  50.15 
 
 		 422 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  45.68 
 
 		 600 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  46.17 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  48.59 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  48.12 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  48.24 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  48.24 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  48.24 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  42.89 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  46.43 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  43.29 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  46.62 
 
 		 452 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  45.08 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  45 
 
 		 446 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  43.15 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  44.79 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  45.1 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  46.33 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  44.76 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  47.18 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  40.19 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  43.57 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.87 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  33.77 
 
 		 374 aa  156  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  34.97 
 
 		 337 aa  156  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  29.48 
 
 		 514 aa  155  8e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.95 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  32.53 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  34.97 
 
 		 337 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.76 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35.05 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  37.45 
 
 		 514 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  39.47 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.58 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  45.24 
 
 		 379 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  29.84 
 
 		 378 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  43.17 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.06 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.13 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  32.6 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  29.97 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  38.18 
 
 		 375 aa  146  7.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  32.65 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.81 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  31.35 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  33.55 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  33.9 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.54 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  31.31 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  32.7 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  33.12 
 
 		 372 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  31.18 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  35.97 
 
 		 372 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  42.08 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  40.69 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  31.67 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  39.35 
 
 		 382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  37.28 
 
 		 434 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  30.47 
 
 		 363 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.12 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  40.95 
 
 		 553 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.73 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  32.92 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  37.28 
 
 		 434 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  37.77 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.18 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.03 
 
 		 362 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  45.41 
 
 		 377 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  31.06 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  42.99 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>