More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2182 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 365 aa  740    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.38 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  41.82 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.09 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  36.49 
 
 		 361 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.51 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 409 aa  215  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40.96 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  35.93 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  35.67 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  35.98 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  35.83 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  40.65 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  35.93 
 
 		 748 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.64 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  34.28 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.5 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  35.39 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  34.73 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  42.49 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  32.59 
 
 		 425 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  33.79 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.31 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  33.15 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  33.42 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.28 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  33.96 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.15 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  32.42 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  36.62 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  34.08 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  35 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  40.33 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 553 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  34.89 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  33.06 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  35.81 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  32 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  34.64 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 442 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  33.95 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  34.54 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  32.41 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 		 668 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.49 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  35.49 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  36.24 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  35.92 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  49.01 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  42.05 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.41 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  39.38 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  32.69 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.69 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.98 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  37.67 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.53 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  42.2 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  32.7 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  32.01 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  32.3 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  32.58 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  37.15 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.41 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  32.29 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  30.75 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  33.69 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  37.66 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  36.76 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  32.4 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  34.91 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.66 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  32.6 
 
 		 372 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  31.37 
 
 		 370 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.59 
 
 		 369 aa  179  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  29.72 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  36.77 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>