More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1572 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 333 aa  681    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  56.39 
 
 		 264 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  44.22 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  43.89 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  43.85 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  39.7 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.41 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.46 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.47 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 		 373 aa  205  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 362 aa  202  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  41.99 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40.13 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.22 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  41.98 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  41.76 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  39.13 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  47.42 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  40.07 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.78 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.59 
 
 		 358 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.14 
 
 		 375 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  46.05 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.43 
 
 		 372 aa  192  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  46.05 
 
 		 289 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  44.04 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.43 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  46.05 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  38.41 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  44.93 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  45.83 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  46.05 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  42.74 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  41.22 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.88 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  45.12 
 
 		 289 aa  188  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.72 
 
 		 356 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  36.52 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  38.93 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  35.18 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  35.18 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 373 aa  185  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  36.33 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  37.1 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.58 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.26 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  43.58 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  37.18 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  45.89 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.25 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  37.13 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  45.02 
 
 		 389 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  35.44 
 
 		 382 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  42.38 
 
 		 365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  41.86 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.23 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  35 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  39.3 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  43.72 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  47.39 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  34.25 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  42.2 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  41.35 
 
 		 280 aa  179  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  38.28 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  44.17 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  35.81 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.52 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  40.83 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  38.3 
 
 		 421 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  36.6 
 
 		 389 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  36.99 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.58 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  33.33 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  35.81 
 
 		 373 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 367 aa  176  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.09 
 
 		 361 aa  175  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  35.81 
 
 		 373 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  39.05 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  38.91 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.83 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.09 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  44.12 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  35.82 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>