More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3881 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  100 
 
 		 289 aa  594  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  97.92 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  97.58 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  96.54 
 
 		 289 aa  578  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  95.85 
 
 		 289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  90.31 
 
 		 289 aa  544  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  90.31 
 
 		 289 aa  541  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  85.12 
 
 		 289 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  68.51 
 
 		 291 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3685  nucleotide-binding SMF protein  93.93 
 
 		 221 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.455152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  47.54 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  42.96 
 
 		 293 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  52.43 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 		 374 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.97 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.28 
 
 		 394 aa  195  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.4 
 
 		 406 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  44.54 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.48 
 
 		 370 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.62 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  47.66 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  44.21 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  46.05 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.55 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  45.45 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  38.49 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  45.25 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  45.28 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.16 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  39.16 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  47.8 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  47.8 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  45.24 
 
 		 374 aa  183  3e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  44.19 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.25 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  46.23 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  43.35 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  46.08 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  46.89 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.61 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 		 291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  45.16 
 
 		 371 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  45.93 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  41.88 
 
 		 389 aa  178  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  42.08 
 
 		 372 aa  178  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.69 
 
 		 360 aa  178  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  44.86 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  43.81 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  38.49 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  38.32 
 
 		 405 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 		 401 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  46.41 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.76 
 
 		 375 aa  175  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  41.82 
 
 		 402 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.11 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  45.85 
 
 		 367 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  45.23 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.26 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  41.57 
 
 		 377 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  45.91 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  45.15 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  40.32 
 
 		 364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0815  DNA processing protein DprA, putative  39.82 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.486528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  43.11 
 
 		 359 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  36.64 
 
 		 379 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  44.29 
 
 		 442 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  45.54 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  39.75 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  43.06 
 
 		 369 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  35.38 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.6 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  38.91 
 
 		 369 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  43.89 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.84 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  43.96 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  43.46 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  41.78 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 385 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  43.06 
 
 		 229 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  45.93 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  41.27 
 
 		 358 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.84 
 
 		 382 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  45.28 
 
 		 425 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  46.19 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  45 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  44.98 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  38.49 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>