More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1380 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 349 aa  703    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  42.17 
 
 		 373 aa  258  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  41.31 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  41.09 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  39.78 
 
 		 361 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 409 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.11 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.25 
 
 		 358 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  45.56 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.22 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  45.19 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  38.3 
 
 		 360 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  45.49 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.21 
 
 		 385 aa  222  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.42 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.68 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  45.64 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.96 
 
 		 281 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  43.88 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.6 
 
 		 374 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  35.39 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.54 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.25 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  44.07 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  45.79 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  45.79 
 
 		 296 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  43.07 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.51 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 365 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  37.71 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  36.16 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  44.35 
 
 		 295 aa  213  5.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.31 
 
 		 372 aa  212  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 386 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 352 aa  212  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  41.2 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.75 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  36.29 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.13 
 
 		 362 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  36.06 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.01 
 
 		 368 aa  208  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  51.46 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 402 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  40.2 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  40.07 
 
 		 748 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  35.24 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 553 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  36.99 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  52.43 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  40.3 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  35.47 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  51.46 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  34.51 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  47.77 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  38.03 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  44.14 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  51.46 
 
 		 289 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.93 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  40.86 
 
 		 291 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  44.09 
 
 		 289 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  50.97 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  36.53 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  35.06 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  35.28 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  35.28 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  35.8 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.25 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 340 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  47.77 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  34.92 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  40.14 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  37.99 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  34.95 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.88 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  37.31 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  40.14 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>