More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0653 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  87.67 
 
 
406 aa  677    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
373 aa  761    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  88.2 
 
 
373 aa  679    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  48.03 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  47.75 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  44.96 
 
 
369 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  46.86 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  43.14 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 
366 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  45.03 
 
 
362 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.61 
 
 
356 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.27 
 
 
359 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  43.35 
 
 
394 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.89 
 
 
358 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  42.17 
 
 
349 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 
409 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41 
 
 
364 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 
362 aa  255  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.83 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.93 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 
371 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  40.44 
 
 
364 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  42.22 
 
 
389 aa  249  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.5 
 
 
359 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.23 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 
375 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  39.42 
 
 
379 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  39.61 
 
 
365 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 
365 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.55 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.5 
 
 
389 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
366 aa  238  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  39.04 
 
 
399 aa  232  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  44.22 
 
 
386 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.68 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  43.77 
 
 
364 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  40.34 
 
 
372 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  41.83 
 
 
375 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  43.88 
 
 
308 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  36.27 
 
 
377 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  37.5 
 
 
748 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 
368 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  40.17 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.53 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.96 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  43.2 
 
 
296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  42.35 
 
 
384 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  34.59 
 
 
372 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.65 
 
 
374 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 
395 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 
388 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  39.13 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  40.38 
 
 
368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 
370 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  37.02 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  34.66 
 
 
380 aa  213  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  43.11 
 
 
365 aa  212  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 
369 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 
382 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 
374 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  37.36 
 
 
374 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36.44 
 
 
379 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  42.6 
 
 
374 aa  211  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 
374 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 
374 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 
374 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  47.46 
 
 
363 aa  210  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  39.37 
 
 
372 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39.65 
 
 
361 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 
374 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.99 
 
 
361 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.6 
 
 
401 aa  209  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.91 
 
 
369 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  43.1 
 
 
385 aa  209  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  40.14 
 
 
365 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  41.97 
 
 
382 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 
356 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 
375 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
360 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  37.88 
 
 
337 aa  206  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.88 
 
 
337 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  40.54 
 
 
402 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  39.3 
 
 
442 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 
333 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.79 
 
 
369 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  41.34 
 
 
377 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.75 
 
 
365 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
360 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 
375 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 
367 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 
375 aa  202  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
369 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  39.35 
 
 
405 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  48.36 
 
 
291 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  40.35 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  41.98 
 
 
401 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>