More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1581 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 425 aa  850    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  56.33 
 
 		 668 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  46.96 
 
 		 367 aa  329  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  58.72 
 
 		 553 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  43.35 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  44.37 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.63 
 
 		 385 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 371 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  49.29 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.81 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.64 
 
 		 370 aa  229  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.62 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  38.22 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  43.68 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  46.79 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  40.6 
 
 		 401 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 359 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.18 
 
 		 359 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.73 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  43.08 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  46.67 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  46.67 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  42.71 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  44.97 
 
 		 358 aa  216  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.97 
 
 		 364 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  43.32 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.03 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  40.68 
 
 		 352 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  38.84 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  49.78 
 
 		 377 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.29 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  45.07 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  43.01 
 
 		 361 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  35.94 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 349 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  38.97 
 
 		 399 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.25 
 
 		 379 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  42.9 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  46.89 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.68 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  48.74 
 
 		 377 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  52.65 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  41.36 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  35.88 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  44.81 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.62 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.97 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 422 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  49.13 
 
 		 405 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  50.47 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  44.13 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  47.83 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  46.67 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  46.44 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  41.77 
 
 		 365 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  42.44 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  47.39 
 
 		 338 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  46.03 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  46.03 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  45.83 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  38.48 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  32.09 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  47.39 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  47.39 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  38.01 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 365 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  32.95 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  43 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  47.79 
 
 		 340 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  42.23 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  47.32 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.69 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  46.22 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  47.58 
 
 		 308 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.07 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  47.66 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  32.24 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  39.44 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  41.64 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.69 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  48.57 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.45 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  46.93 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  49.1 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  41.32 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  36.45 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  40.41 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  33.98 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  48.39 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  48.29 
 
 		 279 aa  194  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  49.26 
 
 		 280 aa  193  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  40.07 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>