More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0189 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 
336 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  59.7 
 
 
372 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  57.14 
 
 
374 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  56.66 
 
 
320 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  55.52 
 
 
401 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  56.93 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  53.39 
 
 
379 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  55.87 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  54.52 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  50.99 
 
 
389 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  54.11 
 
 
401 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  54.65 
 
 
382 aa  329  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  51.06 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  52.65 
 
 
387 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  51.47 
 
 
399 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  53.96 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  48.7 
 
 
409 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  59.46 
 
 
368 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  50.14 
 
 
386 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  47.03 
 
 
421 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  50.28 
 
 
386 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  52.1 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  51.44 
 
 
379 aa  311  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  50.29 
 
 
375 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  46.39 
 
 
422 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  48.97 
 
 
388 aa  309  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  51.34 
 
 
396 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  51.34 
 
 
396 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  51.34 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  51.34 
 
 
434 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  51.34 
 
 
434 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  51.34 
 
 
434 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  51.03 
 
 
434 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  47.21 
 
 
475 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  46.95 
 
 
475 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  50.15 
 
 
422 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  50.43 
 
 
371 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  46.42 
 
 
422 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  46.25 
 
 
448 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  50 
 
 
433 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  49.54 
 
 
422 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  50.62 
 
 
377 aa  295  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 
405 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  51.55 
 
 
377 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  50.43 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  51.64 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  47.78 
 
 
361 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  47.47 
 
 
361 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  52.76 
 
 
394 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  52.35 
 
 
362 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  55.32 
 
 
405 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  45.97 
 
 
358 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  54.14 
 
 
368 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  48.74 
 
 
381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  49.49 
 
 
308 aa  269  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  45.83 
 
 
352 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  48.74 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  49.5 
 
 
362 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  49.15 
 
 
296 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
369 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.54 
 
 
369 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  47.02 
 
 
365 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  52.23 
 
 
365 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  52.9 
 
 
372 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  43.77 
 
 
369 aa  259  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  46.13 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  46.36 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  49.82 
 
 
338 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  49.82 
 
 
338 aa  258  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  46.73 
 
 
365 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  49.82 
 
 
338 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  47.08 
 
 
338 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  50.48 
 
 
366 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  46.15 
 
 
366 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  50.17 
 
 
365 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  50.17 
 
 
365 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  50.17 
 
 
365 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  48.8 
 
 
338 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  52.07 
 
 
362 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3125  DNA protecting protein DprA  49.1 
 
 
425 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 
359 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  49.12 
 
 
340 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  48.45 
 
 
338 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  48.11 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  48.11 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  46.08 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  45.19 
 
 
359 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  48.07 
 
 
338 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  46.15 
 
 
331 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  47.32 
 
 
383 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  46.75 
 
 
311 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  47.08 
 
 
339 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  43.4 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  49.65 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  45.24 
 
 
371 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  44.76 
 
 
369 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  45.72 
 
 
374 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  45.72 
 
 
374 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  45.72 
 
 
374 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>