More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0966 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 442 aa  880    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  59.27 
 
 		 668 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  61.54 
 
 		 553 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  44 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  51.04 
 
 		 367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  47.89 
 
 		 395 aa  257  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.94 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  48.06 
 
 		 356 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  48.5 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  48.5 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  48.5 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  39.4 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.2 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  46.26 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  35.82 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  39.64 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.91 
 
 		 358 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  47.22 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  46.03 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  46.83 
 
 		 338 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  46.43 
 
 		 338 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  46.43 
 
 		 338 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.79 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  42.25 
 
 		 369 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  43.14 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  46.35 
 
 		 338 aa  209  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  43.92 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  45.21 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  45.83 
 
 		 386 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  44.91 
 
 		 366 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  49.09 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  35.92 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  39.3 
 
 		 373 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  35.1 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40.36 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  37.95 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.36 
 
 		 406 aa  203  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  43.65 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  42.86 
 
 		 361 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  43.82 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  34.62 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  39.77 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  42.86 
 
 		 361 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  31.72 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.56 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  51.9 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  51.9 
 
 		 402 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  43.99 
 
 		 365 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.77 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  37.05 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  42.11 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  46.29 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  36.79 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  49.3 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  41.34 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  43.01 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  36.23 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  43.01 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  46.67 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  33.65 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  37.42 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40.06 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  41.75 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  44.33 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  35.59 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  38.73 
 
 		 421 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  45.74 
 
 		 336 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  43.23 
 
 		 365 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.33 
 
 		 369 aa  193  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 372 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  43.45 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  45.67 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  39.52 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  37.96 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  51.9 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  39.83 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.79 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  41.1 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.43 
 
 		 362 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  37.14 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  45.23 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  36.75 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  44.8 
 
 		 369 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  45.23 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  41.51 
 
 		 330 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.66 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.75 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  40.51 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  44.98 
 
 		 338 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  45.29 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>