More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07520 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 409 aa  825    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  45.43 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  43.32 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  42.82 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.19 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  41.76 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40.77 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.81 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.9 
 
 		 372 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.6 
 
 		 406 aa  255  9e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.63 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40.44 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.64 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.32 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.15 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 385 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.81 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  38.83 
 
 		 366 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  35.77 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  36.22 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  37.57 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  36.51 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 368 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  39.23 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 364 aa  223  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  35.66 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.62 
 
 		 368 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.54 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  35.03 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 367 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 381 aa  216  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  34.19 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  34.57 
 
 		 374 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  37.06 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  34.19 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  35.74 
 
 		 362 aa  212  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  35.65 
 
 		 336 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  36.34 
 
 		 748 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  40.2 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.42 
 
 		 369 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  34.22 
 
 		 378 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.07 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  39.17 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  34.43 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  34.16 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  41.92 
 
 		 308 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  34.03 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  35.48 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  35.97 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  32.65 
 
 		 387 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  40.57 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  36.08 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  33.77 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 365 aa  203  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  33.77 
 
 		 381 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  38.19 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  35.91 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  35.28 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 337 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  49.53 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  33.78 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  33.15 
 
 		 370 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  35.22 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.1 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  39.18 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  36.34 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  40.73 
 
 		 365 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  34.64 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>