More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1610 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 370 aa  752    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  58.62 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  56.84 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  56.84 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  54.62 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  51.95 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  51.49 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.27 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.92 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.12 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 359 aa  233  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.43 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  37.4 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.88 
 
 		 406 aa  229  8e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.81 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.07 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.02 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.4 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  40.43 
 
 		 748 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  38.21 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  39.72 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 362 aa  212  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  35.99 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.16 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  39.95 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  41.34 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.8 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.52 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 379 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.26 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  38.27 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  34.39 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  35.83 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.85 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  37.98 
 
 		 371 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  37.16 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.8 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.24 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.81 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  31.06 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.75 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.4 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  38.87 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.94 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  35.53 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 356 aa  196  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.65 
 
 		 361 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.31 
 
 		 368 aa  196  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.87 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  35.83 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  34.83 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  31.28 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  35.43 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  35.64 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  38.02 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  35.51 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  33.96 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  40.7 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  33.33 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  34.14 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.17 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  34.67 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  36.18 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  36.1 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  34.24 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  35.57 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  38.28 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  36 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  36 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  31.12 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  35.18 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  34.95 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  36.41 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  40.77 
 
 		 434 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  33.41 
 
 		 448 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  38.38 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  31.37 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  40.77 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  31.94 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  33.78 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  30.19 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  36.87 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>