More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2083 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 		 337 aa  665    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  68.45 
 
 		 338 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.28 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  44.1 
 
 		 364 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  46.37 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  42.94 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.69 
 
 		 358 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.78 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40.86 
 
 		 385 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  42.9 
 
 		 359 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.84 
 
 		 356 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  42.73 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  42.14 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.7 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.23 
 
 		 369 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  39.35 
 
 		 363 aa  202  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  34.52 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  45.32 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  43.11 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 375 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.51 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  34.19 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.32 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  45.2 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  39.89 
 
 		 374 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  44.2 
 
 		 368 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  41.85 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.56 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41.85 
 
 		 361 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  43.06 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  38.46 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.55 
 
 		 362 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  43.06 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.71 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  43.27 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  39.86 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  39.39 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  34.72 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  48.08 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  35.25 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  41.57 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  42.86 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  48.13 
 
 		 433 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  44.62 
 
 		 448 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  39.36 
 
 		 406 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  48.13 
 
 		 434 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  48.13 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  44.06 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  43.01 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  48.13 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  48.13 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  48.13 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  36.14 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  48.13 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  39.32 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  48.13 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  36.27 
 
 		 402 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  40.97 
 
 		 399 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  43.57 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  42.61 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  45.74 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  38.08 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  44.64 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  45.79 
 
 		 421 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  40.97 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.05 
 
 		 409 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  39.19 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  42.66 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.05 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  39.19 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 380 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 369 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  40.7 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  43.12 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.87 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  45.33 
 
 		 422 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.11 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.68 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  41.84 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>