More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3673 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 366 aa  700    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.11 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.08 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  45.27 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  50.23 
 
 		 366 aa  195  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  49.43 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  43.57 
 
 		 422 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  46.07 
 
 		 365 aa  193  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  43.12 
 
 		 475 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  45.14 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  47.66 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.88 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  46.81 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  43.05 
 
 		 379 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.91 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3125  DNA protecting protein DprA  51.36 
 
 		 425 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  42.49 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  42.29 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  41.25 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  42.9 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  34.17 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  44.62 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  42.38 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  42.66 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  44.81 
 
 		 434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  44.27 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  51.71 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  51.71 
 
 		 401 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.34 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  44.48 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  44.01 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  35.08 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  42.36 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  42.4 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  45.42 
 
 		 433 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  43.07 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.67 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  33.98 
 
 		 364 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  41.61 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  47.48 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  47.48 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  48.33 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  40.98 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  47.48 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  36.31 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  47.48 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  47.48 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  43.13 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  32.58 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  43.83 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  46.64 
 
 		 229 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  44.93 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  38.57 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  35.08 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  32.46 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.13 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  36.83 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  42 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.76 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  41.87 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.99 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  33.93 
 
 		 349 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  43.06 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.75 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  41.38 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  34.65 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  45.17 
 
 		 371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  36.16 
 
 		 338 aa  166  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  34.37 
 
 		 337 aa  166  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.18 
 
 		 377 aa  166  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  39.86 
 
 		 308 aa  166  8e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  39.4 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  40.55 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.73 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  42.44 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.78 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  38.73 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  39.16 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>