More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0567 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 356 aa  705    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40.35 
 
 		 359 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.12 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.76 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.12 
 
 		 358 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.12 
 
 		 364 aa  248  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  37.03 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.1 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  38.62 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 362 aa  226  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.25 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  42.8 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  35.9 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  44.57 
 
 		 364 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.61 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  38.68 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  34.42 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.89 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 330 aa  209  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  35.15 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  34.25 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  35.07 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  34.93 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.35 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  38.38 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  39.03 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  38.77 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  34.08 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.45 
 
 		 406 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  34.95 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.07 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  37.3 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  32.33 
 
 		 367 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  35.78 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.09 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  36.47 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.45 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.11 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  36.47 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  37.93 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  35.26 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  35.52 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.3 
 
 		 372 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 338 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41.43 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  31.23 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  34.57 
 
 		 360 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  41.43 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  43.41 
 
 		 360 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 		 668 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  41.09 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  46.76 
 
 		 291 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  40.96 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  32.34 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  35.65 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  43.02 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  38.6 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 338 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  38.25 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  33.23 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  42.74 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  40.67 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  38.25 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  38.25 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  35.43 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  33.78 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  38.41 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  37.85 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  35.54 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  36.33 
 
 		 553 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  31.93 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  42.05 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  33.24 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  37.77 
 
 		 387 aa  185  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  38 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  32.08 
 
 		 399 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>