More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2345 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 358 aa  692    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  43.55 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 386 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.6 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  45.3 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.05 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  44.73 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.89 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.9 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.32 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.34 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.56 
 
 		 385 aa  205  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.98 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  39.01 
 
 		 366 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.08 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  40.44 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  41.37 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  38.28 
 
 		 402 aa  202  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 360 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.9 
 
 		 371 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  31.93 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 389 aa  196  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.41 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  30.05 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  39.57 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 364 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  35.64 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.03 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  33.89 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  34.87 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  33.52 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.62 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  37.7 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.33 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  40.59 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  39.45 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.34 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  41.37 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.33 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  38.93 
 
 		 377 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  38.23 
 
 		 365 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.6 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  38.55 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  41.98 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.47 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  30.35 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.67 
 
 		 375 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 395 aa  179  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  44.81 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  44.81 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  44.81 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  44.81 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.77 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  45.18 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  38.42 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  30.45 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  36.87 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  44.4 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  38.66 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.89 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 668 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  44.4 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  34.73 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  41.31 
 
 		 592 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  44.4 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.62 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  31.9 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  36.74 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  36.74 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  37.02 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  33.61 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  38.91 
 
 		 396 aa  176  8e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  39.94 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  30.59 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  40.66 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  35.89 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  41.47 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  34.62 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  38.81 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  40.96 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  31.71 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  37.44 
 
 		 422 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>