More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3341 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 385 aa  784    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.17 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  44.84 
 
 		 359 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.17 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 		 370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  44.84 
 
 		 359 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.51 
 
 		 361 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 		 386 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40.33 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  41.13 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  41.91 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  38.88 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 362 aa  238  9e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39.95 
 
 		 385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  43.09 
 
 		 365 aa  235  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  43.09 
 
 		 365 aa  235  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  50.18 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  40.81 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  38.69 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.38 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.13 
 
 		 369 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.95 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.68 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  40.37 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.11 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.48 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  40.16 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  39.05 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.58 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.84 
 
 		 366 aa  223  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.21 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  41.13 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  44.33 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.58 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  39.68 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  37.73 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  39.14 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  38.63 
 
 		 374 aa  219  8.999999999999998e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  38.81 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  38.48 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  38.21 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  43.58 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  37.75 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 405 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  38.52 
 
 		 377 aa  215  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  44.83 
 
 		 352 aa  215  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.9 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  44.21 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  36.99 
 
 		 421 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  44.21 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  37.6 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.02 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  37.63 
 
 		 365 aa  213  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.94 
 
 		 388 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  41.14 
 
 		 374 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  36.96 
 
 		 366 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  43 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.55 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  37.17 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  38.36 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  37.08 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.13 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  35.17 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  49.11 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  35.32 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  36.77 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  36.43 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  39.73 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  42.67 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  38.65 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.15 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  42.67 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  38.14 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  41.78 
 
 		 448 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  42.41 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 422 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.56 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  39.26 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  44.88 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  43.2 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>