More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0415 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 382 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  57.14 
 
 		 382 aa  411  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  50.66 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  51.22 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  48.18 
 
 		 385 aa  342  8e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  50.13 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  53.73 
 
 		 286 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.15 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.9 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.06 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.36 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  36.61 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  35.91 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.57 
 
 		 366 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.72 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.95 
 
 		 362 aa  212  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  36.97 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  37.96 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.56 
 
 		 369 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  33.69 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.43 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.44 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  34.92 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.79 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  36.34 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  36.07 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  32.09 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  33.79 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.03 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  35.56 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  33.88 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  36.27 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  32.52 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  41.7 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  33.52 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  35.66 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.07 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  31.65 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  41.34 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  33.78 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  31.72 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  28.91 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  39.01 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  39.01 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  35.77 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 		 374 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 386 aa  186  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  36.01 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  32.52 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  35.05 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  36.64 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  33.61 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  32.81 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.33 
 
 		 369 aa  182  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  31.51 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.38 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.34 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  37.46 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  43.15 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  33.78 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  37.41 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  33.89 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  32.24 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  33.68 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  36.61 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.99 
 
 		 369 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  34.32 
 
 		 368 aa  179  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  31.65 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>