More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0663 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 364 aa  753    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  56.35 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  54.14 
 
 		 366 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  44.99 
 
 		 378 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  44.72 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  44.26 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  42.74 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 370 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  39.34 
 
 		 374 aa  249  7e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  34.53 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 370 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 359 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  32.25 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  31.71 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  32.34 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  32.68 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  31.28 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  33.97 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  33.43 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  32.41 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  33.15 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  34.09 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  33.51 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  32.24 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  33.06 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  35.09 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  33.96 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  32.13 
 
 		 356 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  33.52 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  31.78 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  33.61 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  32.78 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  32.77 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.35 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  30.19 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  31.11 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  33.24 
 
 		 406 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  31.36 
 
 		 360 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  31.78 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  31.79 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  31.97 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  37.15 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  31.59 
 
 		 389 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  32.29 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  32.44 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  36.63 
 
 		 748 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.26 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  34.16 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  29.04 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  32.52 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  33.13 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  31.23 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  32.87 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  29.14 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.16 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  32.54 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  30.19 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  31.61 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  32.69 
 
 		 389 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  33.96 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  34.39 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.01 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  32.14 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  30.79 
 
 		 385 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  34.43 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  32.01 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  32.65 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  33.11 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  34.92 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  30.79 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  32.09 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  31.23 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  31.23 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  30.65 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  31.52 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  32.3 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  35.79 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  34.88 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  32.35 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  31.09 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  31.44 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  31.25 
 
 		 361 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  33.13 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  31.44 
 
 		 434 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  33.13 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.15 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  33.13 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  33.68 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  34.12 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  33.97 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  29.4 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  32.78 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>