More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4073 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 368 aa  761    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  95.38 
 
 		 748 aa  731    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.08 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.95 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  38.5 
 
 		 373 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.67 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.37 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40 
 
 		 356 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 		 374 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.62 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  41.48 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.59 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  35.39 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  33.06 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  33.06 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  40.43 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  35.16 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 375 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  34.96 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  34.51 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  34.63 
 
 		 380 aa  205  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 359 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  32.96 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.54 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35.28 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  35.36 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  34.53 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.07 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  32.21 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.18 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  34.05 
 
 		 401 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  32.34 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  30.86 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  35.64 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  32.79 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  32.31 
 
 		 364 aa  185  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.97 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  32.05 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  31.63 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  33.69 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  34.07 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.05 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  32.44 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  33.15 
 
 		 394 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  36.26 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  36.92 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  33.24 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  33.92 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  34.89 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  31.38 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.86 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  36.76 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  33.12 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  36.97 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  31.77 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  31.12 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  34.32 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  31.94 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  36.03 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  33.25 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 364 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  35.56 
 
 		 442 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  31.12 
 
 		 475 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.52 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.26 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  36.58 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  36.67 
 
 		 374 aa  174  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  31.85 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  34.51 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  31.08 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  30.87 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  36.6 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  40.33 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  31.32 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  33.79 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  33.43 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  35.09 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  33.25 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  35.03 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  34.83 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  35.86 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  31.69 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>