More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2723 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 369 aa  750    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.48 
 
 		 358 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  38.67 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 		 374 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.64 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  36.16 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.42 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  37.2 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  34.55 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  34.71 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 375 aa  225  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.12 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  35.57 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  34.73 
 
 		 359 aa  222  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  36.26 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  34.45 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.34 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.38 
 
 		 406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.77 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  39.33 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  35.5 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  37.62 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.2 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  33.81 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  35.62 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.24 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  33.33 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  34.42 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 385 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  35.19 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  31.35 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  34.71 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  34.41 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  35.5 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  32.23 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  33.52 
 
 		 748 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  32.96 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.07 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  31.67 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.47 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.1 
 
 		 409 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.3 
 
 		 401 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  34.96 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  34.19 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 434 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  34.26 
 
 		 364 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  34.62 
 
 		 377 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  34.1 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  34.58 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  34.1 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  34.1 
 
 		 434 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  34.1 
 
 		 434 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  32.51 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 402 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  34.6 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  45.78 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  34.29 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  37.15 
 
 		 337 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  39.59 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  41.52 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  32.82 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.79 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  39.39 
 
 		 337 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  34.49 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  38.85 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  30.96 
 
 		 475 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  36.14 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 442 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  35.84 
 
 		 668 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  33.05 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  34.64 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  38.49 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  36.4 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  30.71 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  34.34 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  34.9 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  46.6 
 
 		 229 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  32.49 
 
 		 365 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  45.11 
 
 		 291 aa  189  7e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  32.49 
 
 		 365 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  35.85 
 
 		 358 aa  189  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  37.81 
 
 		 338 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  36.3 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.03 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  34.5 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>