More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0660 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
375 aa  766    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  99.2 
 
 
375 aa  759    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  69.52 
 
 
374 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  60 
 
 
372 aa  461  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  58.84 
 
 
380 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  56.84 
 
 
370 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  47.48 
 
 
402 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 
360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 
366 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 
409 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 
364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40 
 
 
385 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 
394 aa  223  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  40.59 
 
 
336 aa  222  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.33 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  36.34 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  36.49 
 
 
358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.61 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.23 
 
 
373 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  37.16 
 
 
361 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.57 
 
 
365 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 
370 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.89 
 
 
361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.67 
 
 
320 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.41 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.94 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 
373 aa  216  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  38.83 
 
 
371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  39.14 
 
 
389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.81 
 
 
368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 
365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  37.47 
 
 
365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.93 
 
 
366 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 
359 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.32 
 
 
364 aa  212  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  38.01 
 
 
375 aa  212  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  40.53 
 
 
337 aa  212  9e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  39.53 
 
 
379 aa  212  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.65 
 
 
369 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.62 
 
 
374 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  40.53 
 
 
337 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.48 
 
 
371 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 
359 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  38.07 
 
 
422 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  34.23 
 
 
368 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  39.09 
 
 
421 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  35.19 
 
 
388 aa  208  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  38.07 
 
 
331 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  35.94 
 
 
401 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.04 
 
 
389 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  35.23 
 
 
748 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.58 
 
 
382 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.66 
 
 
356 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 
381 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 
338 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.18 
 
 
369 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  42.91 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 
338 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  35.73 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  35.24 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  42.66 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.25 
 
 
374 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  38 
 
 
338 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.96 
 
 
356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.84 
 
 
362 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.04 
 
 
379 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 
340 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  34.76 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  40.68 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  40.68 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  40.68 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  40.68 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  33.6 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.04 
 
 
349 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  36.95 
 
 
399 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  37.69 
 
 
362 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  35.25 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  36.46 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  34.81 
 
 
408 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  38.73 
 
 
368 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.65 
 
 
362 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.21 
 
 
402 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  30.69 
 
 
378 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  34.5 
 
 
386 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.8 
 
 
369 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  40.4 
 
 
379 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  41.23 
 
 
371 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  39.76 
 
 
375 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 
364 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 
401 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  36.7 
 
 
434 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 
377 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  36.29 
 
 
382 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  36.7 
 
 
434 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>