More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3792 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  100 
 
 
372 aa  762    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  60.26 
 
 
380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  60.27 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  60 
 
 
375 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  59.57 
 
 
374 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  58.36 
 
 
370 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  47.21 
 
 
402 aa  322  8e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 
409 aa  262  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 
364 aa  250  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40.49 
 
 
359 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.84 
 
 
371 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.84 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 
359 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 
359 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  36.36 
 
 
361 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  39.68 
 
 
368 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 
365 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.23 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.34 
 
 
373 aa  229  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  37.36 
 
 
356 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  36.16 
 
 
358 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.97 
 
 
370 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 
360 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  39.36 
 
 
367 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.96 
 
 
368 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.91 
 
 
372 aa  223  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.93 
 
 
364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.37 
 
 
362 aa  223  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.03 
 
 
394 aa  222  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  35.45 
 
 
388 aa  219  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 
399 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  34.59 
 
 
373 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.13 
 
 
336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  37.77 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  31.27 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.69 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.95 
 
 
385 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.13 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.31 
 
 
349 aa  212  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  35.28 
 
 
363 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  39.32 
 
 
337 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  39.32 
 
 
337 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.89 
 
 
356 aa  210  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.15 
 
 
401 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.93 
 
 
382 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  35.87 
 
 
364 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  36.53 
 
 
379 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  39.32 
 
 
362 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.77 
 
 
375 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  34.31 
 
 
374 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.1 
 
 
375 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 
389 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  34.96 
 
 
368 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.38 
 
 
369 aa  205  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.48 
 
 
389 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 
364 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 
375 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.07 
 
 
361 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.26 
 
 
365 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  36.1 
 
 
386 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.07 
 
 
361 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 
377 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 
408 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  35.84 
 
 
386 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  34.76 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  35.39 
 
 
748 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  35.04 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  35.04 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.75 
 
 
399 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 
373 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 
373 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  35 
 
 
399 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  35.6 
 
 
384 aa  199  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  38.64 
 
 
308 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.19 
 
 
374 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  34.51 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 
379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 
402 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  35.29 
 
 
358 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  40.59 
 
 
381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  40.59 
 
 
381 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  38.18 
 
 
377 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  35.75 
 
 
434 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  35.75 
 
 
434 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  34.22 
 
 
425 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  32.37 
 
 
381 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 
331 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  34.39 
 
 
372 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 
369 aa  192  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  33.57 
 
 
409 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  35.31 
 
 
405 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  33.72 
 
 
422 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  35.49 
 
 
387 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 
366 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  31.99 
 
 
374 aa  191  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 
382 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>