More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4590 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 360 aa  721    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  87.78 
 
 		 360 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  48.03 
 
 		 373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  46.35 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  46.35 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  53.24 
 
 		 362 aa  339  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  47.91 
 
 		 369 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  48.59 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  42.34 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  46.53 
 
 		 356 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  44.89 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  44.51 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.92 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  44.83 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 375 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  43.02 
 
 		 394 aa  255  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.71 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.79 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.47 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.67 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  44.23 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  40.78 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.11 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  43.18 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.56 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.86 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.99 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  39.2 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.43 
 
 		 364 aa  232  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  38.78 
 
 		 402 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  42.7 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.45 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  43.42 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  39.62 
 
 		 374 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  39.81 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  40.4 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  37.15 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  41.29 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  43.88 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.87 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  42.03 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 382 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  39.49 
 
 		 375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  39.48 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  43.27 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  35.31 
 
 		 380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.74 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  39.14 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.42 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.06 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  42.42 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  41.61 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  42.65 
 
 		 308 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  35.15 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  38.27 
 
 		 377 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  39.86 
 
 		 748 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.22 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  42.73 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  40.59 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  41.61 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 374 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  35.15 
 
 		 360 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  44.57 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  39.53 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  46.74 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  36.31 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  41.64 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  41.49 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  38.51 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  42.76 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>