More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0674 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  99.11 
 
 		 337 aa  680    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 337 aa  686    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  44.22 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  43.38 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  41.99 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  46.28 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.48 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.87 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.9 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.65 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.53 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  39.66 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.18 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.28 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  39.32 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.99 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  41.61 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  41.32 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 371 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  41.32 
 
 		 375 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.02 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.88 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  42.7 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.49 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.05 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.19 
 
 		 385 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  36.01 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.38 
 
 		 366 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  46.89 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.04 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  36.9 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 409 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  40.32 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.05 
 
 		 369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.33 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  40.75 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  41.81 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  36.03 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.44 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  35.71 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  40.32 
 
 		 402 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  37.98 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.56 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  37.15 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  35.78 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  37.07 
 
 		 402 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  38.83 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  35.53 
 
 		 359 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  38.25 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 374 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  36.93 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  38.83 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  36.88 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  42.42 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  46.31 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.25 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.68 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.87 
 
 		 336 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  39.01 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  39.3 
 
 		 434 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  38.24 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  39.79 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  39.3 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  39.33 
 
 		 395 aa  188  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  38.24 
 
 		 748 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  36.36 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  36.01 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  36.7 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  37.63 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  38.17 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  38.3 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  44.34 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  44.34 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  44.34 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  44.34 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  43.87 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  44.34 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  42.74 
 
 		 370 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.6 
 
 		 368 aa  185  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.96 
 
 		 383 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  38.84 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  40.22 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.97 
 
 		 365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>