More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1675 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  98.89 
 
 		 360 aa  712    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 360 aa  719    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  39.23 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  32.56 
 
 		 358 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  35.88 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.41 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  33.91 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  35.15 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 338 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.49 
 
 		 359 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  37.59 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  37.59 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 364 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  34.33 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 338 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 338 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  33.06 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 369 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.45 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  33.06 
 
 		 748 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  35.28 
 
 		 374 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  32.04 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 		 363 aa  202  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  35.61 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  36.21 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  33.92 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.31 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.06 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.84 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  32.6 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.95 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  32.23 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  34.19 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  34.75 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  31.34 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  34.16 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  35.4 
 
 		 372 aa  195  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  34.71 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  34.34 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.64 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  36.93 
 
 		 337 aa  192  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  36.93 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  31.32 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  31.85 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  30.87 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  43.02 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  34.57 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.34 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  36.17 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  39.32 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  32.26 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  35.86 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  33.57 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  32.5 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  33.44 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.21 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  30.15 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  32 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.02 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  49.03 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.07 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  38.98 
 
 		 362 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  32.53 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  43.63 
 
 		 295 aa  186  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  40.91 
 
 		 426 aa  186  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  30.34 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  30.34 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  37.88 
 
 		 372 aa  184  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  31.55 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  32.56 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.11 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  44.39 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  33.9 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  37.82 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  32.35 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>