More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1230 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  768    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  45.14 
 
 		 364 aa  298  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  44.11 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  40.8 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 378 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  38.63 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  36.8 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  39.25 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  39.34 
 
 		 364 aa  249  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  36.93 
 
 		 366 aa  239  8e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  35.44 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  34.71 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  33.69 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  31.68 
 
 		 358 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 362 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.25 
 
 		 371 aa  202  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  31.72 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  34.58 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  34.79 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  36.03 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.04 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  34.15 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.69 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.83 
 
 		 370 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  31.99 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  32.04 
 
 		 356 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  33.87 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  34.04 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  32.79 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  32.22 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.95 
 
 		 374 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  33.25 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 375 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.06 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  32 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  32.42 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  33.33 
 
 		 748 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  38.66 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  33.52 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.09 
 
 		 366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  32.09 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  32.02 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  32.7 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  34.41 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  34.8 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  31.32 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  35.81 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.15 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  36.63 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  34.62 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  35.84 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  33.33 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  33.6 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  32.71 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  32.51 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  32.7 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.23 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  32.63 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  31.19 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  31.4 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  31.82 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  31.4 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  31.35 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  34.31 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  30.87 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  32.25 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  32.37 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  31.38 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  37.41 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  36.91 
 
 		 422 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  29.92 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  32.04 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  31.72 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  31.97 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  31.23 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  33.42 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  33.42 
 
 		 361 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  33.74 
 
 		 395 aa  162  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  31.03 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  32.89 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  37.32 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  35.04 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  31.36 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  31.55 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  40.61 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>