More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1000 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 395 aa  794    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  42.48 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  48.77 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  39.44 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  47.58 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  41.21 
 
 		 394 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.18 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  46.34 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  49.53 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  41.79 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  41.48 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  37.06 
 
 		 600 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  38.82 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  38.62 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  38.95 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  47.13 
 
 		 371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  35.95 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  37.35 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  37.35 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  37.35 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  39.19 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  37.31 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  36.34 
 
 		 408 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  37.08 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  41.63 
 
 		 349 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  33.74 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  36.53 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  36.13 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  32.34 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  38.76 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  33.85 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  32.34 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  35.87 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  34.45 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  37.05 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.79 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  35.78 
 
 		 364 aa  150  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.9 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  40.62 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 362 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  33.47 
 
 		 363 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  37.8 
 
 		 514 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.21 
 
 		 356 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  34.82 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  37.21 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  38.33 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  43.6 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  33.77 
 
 		 368 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.35 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  34.46 
 
 		 361 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.72 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  35.17 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  39.19 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  36.65 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  34.2 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  41.78 
 
 		 418 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.19 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39.71 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  33.94 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  29.76 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  40.53 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  34.18 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  33.44 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  38.56 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  30.49 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  31.43 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  40.91 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  34.23 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  29.06 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  35.37 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  42.41 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  34.06 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  34.25 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  36.28 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40.65 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  32.83 
 
 		 336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  32.92 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.22 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  34.96 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>