More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1480 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 402 aa  753    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  54.52 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  50.9 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  50.81 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  49.74 
 
 		 386 aa  279  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  49.32 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  47.3 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  52.04 
 
 		 395 aa  269  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  48.2 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  46.94 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  47.62 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  46.55 
 
 		 391 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  45.88 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  44.66 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  43.42 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  46.97 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  44.03 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  48.41 
 
 		 383 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  50.5 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  44.36 
 
 		 600 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  47.91 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  50.81 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  50.81 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  50.81 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  48.61 
 
 		 446 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  47.68 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  49.19 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  46.57 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  48.76 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 349 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  46.58 
 
 		 389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  46.41 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40.38 
 
 		 385 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  29.94 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.44 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  31.88 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.02 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.71 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.01 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  31.77 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.98 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  37.11 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  36.04 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  46.04 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  35 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  38.62 
 
 		 514 aa  139  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  35.08 
 
 		 361 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.33 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  36.25 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.4 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  33.23 
 
 		 364 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 396 aa  135  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  40.81 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.02 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  39.09 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  31.76 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  34.83 
 
 		 374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  38.38 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.83 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  43.61 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 		 418 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.43 
 
 		 375 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  39.91 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  37.56 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  39.75 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  34.89 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  29.7 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.74 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  32.9 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  33.78 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.32 
 
 		 388 aa  131  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  32.18 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  36.9 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  30.42 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.39 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  35.64 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 372 aa  129  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  36.84 
 
 		 368 aa  129  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  32.04 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  40.34 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  33.83 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.17 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  39.21 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>