More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1548 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 391 aa  756    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  50 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  48.84 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  51.69 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  50.27 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  50.4 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  47.13 
 
 		 600 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  46.44 
 
 		 452 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  46.56 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  47.43 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  47.24 
 
 		 388 aa  265  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  52.13 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  51.08 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  56.42 
 
 		 400 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  46.51 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  46.38 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  45.62 
 
 		 376 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  45.62 
 
 		 376 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  45.62 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  46.55 
 
 		 402 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  44.79 
 
 		 424 aa  242  7e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  45.27 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  43.91 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  47.18 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  44.22 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  43.54 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  47.38 
 
 		 386 aa  229  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  45.15 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  45.54 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  43.57 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  51.49 
 
 		 310 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  43.03 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  46.34 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  49.34 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 514 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  38.87 
 
 		 361 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.56 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.31 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.64 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  42.13 
 
 		 409 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  45.54 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  38.23 
 
 		 389 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  42.01 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  45.98 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  43.43 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  42.01 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  46.51 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  39.59 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  47.3 
 
 		 360 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  43.33 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  43.52 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  47.55 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.67 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  45.21 
 
 		 337 aa  156  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  45.21 
 
 		 337 aa  156  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.49 
 
 		 362 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  34.92 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  45.58 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  45.49 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.14 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 359 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  46.15 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  45.34 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  42.38 
 
 		 434 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  42.38 
 
 		 434 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  46.64 
 
 		 592 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  40.61 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  42.38 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  37.62 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  42.38 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  44.88 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  45.34 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  44.14 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  44.07 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  36.75 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  42.26 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  44.07 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.68 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  43.36 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  31.36 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  42.24 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  43.72 
 
 		 422 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.1 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  44.26 
 
 		 475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  38.36 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  38.85 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>