More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2097 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 374 aa  720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  52.19 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  51.82 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  49.73 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  51.21 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  52.03 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  51.76 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  51.76 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  51.6 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  46.02 
 
 		 423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  46.02 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  48.45 
 
 		 402 aa  245  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  46.32 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  47.28 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  48.73 
 
 		 386 aa  235  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  49.03 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  45.32 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  47.34 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.58 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  47.68 
 
 		 600 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  45.31 
 
 		 475 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  44.9 
 
 		 399 aa  215  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 444 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  41.25 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  46.21 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  47.77 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  41.94 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  44.33 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  44.41 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  40.49 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  40.73 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  44.11 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  35.95 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  36.67 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  31.51 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.96 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.83 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  33.33 
 
 		 748 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  29.5 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  31.27 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.08 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  30.45 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  30.89 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  42.92 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  35.64 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.98 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  34.85 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.98 
 
 		 362 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  32.27 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.26 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  34.74 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  44.5 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  32.14 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  40.77 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  32.42 
 
 		 406 aa  136  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  42.93 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.97 
 
 		 331 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 368 aa  135  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  32.87 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  37.83 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  42.41 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  29.39 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  43.72 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  32.23 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 		 434 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  31.58 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 372 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.08 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  33.59 
 
 		 514 aa  132  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  26.26 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  45.26 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.59 
 
 		 389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  45.26 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  42.86 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  33.19 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  27.3 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  40.15 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  30.87 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.8 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  44.74 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  35.35 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.33 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  43.32 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  35.55 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>