More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12910 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  743    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  67.93 
 
 		 376 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  67.66 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  67.66 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  63.1 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  66.49 
 
 		 379 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  51.6 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  50.13 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  49.61 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  48.02 
 
 		 422 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  43.38 
 
 		 423 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  47.18 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  46.83 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  49.23 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  44.09 
 
 		 394 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  49.86 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  43.99 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  43.87 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 399 aa  225  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  47.15 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  43.83 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  47.28 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  43.25 
 
 		 600 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  45.3 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  44.55 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  46.76 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  41.35 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  47.7 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  46.06 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  46.37 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  48.16 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  40.91 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  38.55 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  45.97 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  45.9 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  32.62 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.05 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.19 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  35.33 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  33.53 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.1 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  32.21 
 
 		 748 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  35.97 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.31 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.58 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  36.92 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.02 
 
 		 368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  35.13 
 
 		 406 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  32.01 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  40.2 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  41.26 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  32.39 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  31.19 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.28 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.49 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  32.08 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  30.72 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  42.98 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.95 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  31.46 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  36.84 
 
 		 377 aa  149  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.97 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  35.48 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  30.98 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  41.09 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.02 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 378 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  27.99 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  40.08 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  40.26 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  31.49 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.55 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  34.17 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  36.92 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.76 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  31.46 
 
 		 333 aa  143  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  36.06 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.69 
 
 		 377 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36.59 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  31.49 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  37.83 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  36.58 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.16 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2694  DNA protecting protein DprA  46.64 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0256425  normal  0.190836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  48.59 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  44.16 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>