More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2511 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 386 aa  719    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  52.03 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  48.85 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  48.74 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  52.78 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  49.62 
 
 		 424 aa  279  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  49.74 
 
 		 402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  49.74 
 
 		 395 aa  246  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.53 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  48.73 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  42.48 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  44.03 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  45.48 
 
 		 475 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  49.04 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  45.93 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  47.97 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  43.68 
 
 		 600 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  47.38 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  46.32 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  46.11 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  47.81 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  44.65 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  41.37 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  41.37 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  41.37 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  44.67 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  42.03 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  40.84 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  44.63 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 452 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  42.64 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  44.62 
 
 		 310 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  41.49 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  41.93 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  45.06 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  45.54 
 
 		 400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  46.06 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  39.03 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  44.96 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.14 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  47.73 
 
 		 375 aa  169  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  42.86 
 
 		 514 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  39.88 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  38.28 
 
 		 382 aa  166  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  39.56 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 372 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  33.78 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  39.87 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  37.22 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  46.35 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  45.74 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.99 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  35.99 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  35.78 
 
 		 373 aa  156  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  49.22 
 
 		 385 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.1 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  40.14 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  31.39 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  39.54 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.33 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.99 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  41.55 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  35.16 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  44.24 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  37.97 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  35.14 
 
 		 336 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  42.92 
 
 		 360 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  37.97 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  40.69 
 
 		 378 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  37.34 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  36 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  34.54 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  37.62 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  28.15 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.16 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  40.36 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  45.81 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  45.66 
 
 		 592 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.28 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.14 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  36.81 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  34.95 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  30.9 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  40.17 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  39.69 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  47.37 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  39.74 
 
 		 422 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  44.69 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  34.95 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>